PotatoPepDB
قاعدة بيانات ومنصة تحليل منسّقة للببتيدات المضادة للميكروبات من نبات البطاطس.
بوتيتوبيبديبي منصة معلوماتية حيوية لاكتشاف ونمذجة وتحليل الببتيدات المضادة للميكروبات (AMPs) المستخلصة من البطاطس. تجمع بين مستودع ببتيدات قابل للبحث وأدوات تحليل فيزيائيكيميائي، ومحرك محاذاة على طراز BLAST، وتصور بيانات تفاعلي.
مصممة لباحثي التقنية الحيوية النباتية العاملين على المبيدات الحيوية والمحاصيل المقاومة للأمراض، تجعل جزيئات الدفاع النباتي الطبيعية سهلة الاستكشاف — دون الحاجة لتسجيل الدخول.
الميزات
Simple & Advanced Search
Search by name, sequence, accession, tissue, activity, or molecular properties with logical filters.
Physicochemical Calculator
Real-time MW, pI, net charge, GRAVY, Boman index, hydrophobic ratio, and instability index.
BLAST-Style Alignment
Smith-Waterman local alignment against the database with E-value and identity scores.
Statistics Dashboard
Interactive pie, bar, and scatter charts for tissue, activity, and charge-hydrophobicity analysis.
3D Structure Viewer
NGL.js molecular visualization with PDB structures and RCSB integration.
Multi-Format Export
Download peptide data and structures as JSON, CSV, FASTA, or PDB.
FASTA Bulk Import
Admin batch import of peptides from FASTA files.
Curated Reference Data
Reference potato peptides (Snakin-1/2, defensins, Kunitz inhibitors) ready to explore.
Open Access
Fully public database — no paywall, no login for browsing or analysis.
لقطات الشاشة
واجهة المنتج معروضة بالفارسية.
المزايا الرئيسية
Niche, high-value focus
Purpose-built for potato AMP research, not a generic protein lookup.
Analysis built-in
Calculator, BLAST, and 3D viewer in one place — no external tools needed.
Researcher-friendly UX
Modern, responsive interface with live visualizations for bench scientists.
Scientifically grounded
Led by plant-biotech researchers; standard bioinformatics metrics and algorithms.
مقارنة مع المنافسين
| الإمكانية | PotatoPepDB | APD3 | UniProt | NCBI BLAST |
|---|---|---|---|---|
| Potato-specific AMP focus | ✓ | ✗ | ✗ | ✗ |
| Physicochemical calculator | ✓ | ✓ | ~ | ✗ |
| Sequence alignment | ✓ | ✗ | ~ | ✓ |
| 3D structure viewer | ✓ | ✗ | ✓ | ✗ |
| Interactive stats dashboard | ✓ | ~ | ✗ | ✗ |
| Open access, no login | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ |
APD3, UniProt, and NCBI BLAST are excellent general resources; PotatoPepDB complements them with a focused potato-AMP dataset and an integrated analysis toolkit.
الأسعار
اشترك على خوادمنا، أو احصل على ترخيص للتثبيت على خوادمك الخاصة.
الأسعار بالدولار الأمريكي، تُدفع بالعملة المشفرة.
Lab
يمكن الإلغاء في أي وقت
- ✓Full peptide dataset
- ✓BLAST and advanced search
- ✓Up to 5 researchers
Institute
يمكن الإلغاء في أي وقت
- ✓Everything in Lab
- ✓Private datasets
- ✓API access
Enterprise
- ✓Unlimited scale
- ✓Dedicated onboarding
- ✓Custom SLA
رسم لمرة واحدة للتثبيت على بنيتك التحتية الخاصة.
On-premise licence
دفعة أولى $560، ثم 6 دفعات شهرية بقيمة $140
بدون رسوم إضافية للدفع بالتقسيط · Includes 1 year of updates and support; renews at 20%/year
- ✓Installed on your own servers
- ✓Data never leaves your network
- ✓Unlimited users, no per-seat fee
Enterprise licence
- ✓Multi-site deployment and staging
- ✓SLA, on-site training and handover
- ✓Custom development and integrations
بُنيت باستخدام
الأسئلة الشائعة
ما هو PotatoPepDB؟
قاعدة بيانات منتقاة للببتيدات المضادة للميكروبات (AMPs) المستخرجة من البطاطس Solanum tuberosum، مع أدوات تحليل مدمجة. موجّهة لباحثي التقنية الحيوية النباتية العاملين على المبيدات الحيوية والمحاصيل المقاومة للأمراض، وتضم ببتيدات مرجعية مثل Snakin-1/2 والديفنسينات ومثبطات Kunitz.
هل أحتاج إلى حساب لاستخدامه؟
لا. قاعدة البيانات العامة مفتوحة الوصول، بلا اشتراك ولا تسجيل دخول للتصفح أو التحليل. الخطط المدفوعة للمختبرات والمعاهد التي تريد مقاعد لفريقها أو مجموعات بيانات خاصة أو واجهة API.
ما أدوات التحليل المتوفرة؟
حاسبة فيزيائية كيميائية (MW وpI والشحنة الصافية وGRAVY ومؤشر Boman ونسبة الكراهية للماء ومؤشر عدم الاستقرار)، ومحاذاة محلية Smith-Waterman مقابل قاعدة البيانات مع قيم E ونسب التطابق، وعارض بنية ثلاثي الأبعاد NGL.js مرتبط بـRCSB، ورسوم إحصائية تفاعلية.
كم التكلفة للمختبر أو المعهد؟
خطة Lab بسعر 25 دولارًا شهريًا لما يصل إلى 5 باحثين مع البيانات الكاملة وBLAST والبحث المتقدم. خطة Institute بسعر 69 دولارًا شهريًا وتضيف مجموعات بيانات خاصة وواجهة API. خطة Enterprise يُحدَّد سعرها حسب العقد، ورخصة التثبيت على خوادمك بسعر 1400 دولار مع سنة من التحديثات والدعم، وتُجدَّد بنسبة 20% سنويًا.
هل يمكنني تصدير البيانات؟
نعم. تُحمَّل سجلات الببتيدات والبنى بصيغ JSON أو CSV أو FASTA أو PDB. ويمكن للمسؤولين أيضًا استيراد ببتيدات جديدة دفعةً واحدة من ملفات FASTA.
جرّب PotatoPepDB اليوم
املأ النموذج للحصول على عرض توضيحي مخصص وأسعار تناسب عملك.