PotatoPepDB
پایگاه داده و سکوی تحلیل پپتیدهای ضدمیکروبی استخراجشده از سیبزمینی (Solanum tuberosum).
پوتیتوپپدیبی یک سکوی بیوانفورماتیک برای کشف، مدلسازی و تحلیل پپتیدهای ضدمیکروبی (AMP) استخراجشده از سیبزمینی است. این پلتفرم یک مخزن قابلجستجوی پپتید را با ابزارهای تحلیل فیزیکوشیمیایی، موتور همترازی شبیه BLAST و مصورسازی تعاملی داده ترکیب میکند.
ساختهشده برای پژوهشگران بیوتکنولوژی گیاهی در حوزهٔ آفتکشهای زیستی و محصولات مقاوم به بیماری — کاوش مولکولهای دفاعی طبیعی گیاه را آسان میکند، بدون نیاز به ورود.
ویژگیها
جستجوی ساده و پیشرفته
جستجو بر اساس نام، توالی، شناسه، بافت، فعالیت یا خواص مولکولی با فیلترهای منطقی.
ماشینحساب فیزیکوشیمیایی
محاسبهٔ بلادرنگ MW، pI، بار خالص، GRAVY، شاخص Boman، نسبت آبگریزی و شاخص ناپایداری.
همترازی بهسبک BLAST
همترازی محلی Smith-Waterman در برابر پایگاه داده با مقدار E و امتیاز شباهت.
داشبورد آماری
نمودارهای تعاملی دایرهای، میلهای و پراکندگی برای تحلیل بافت، فعالیت و بار-آبگریزی.
نمایشگر ساختار سهبعدی
مصورسازی مولکولی با NGL.js بههمراه ساختارهای PDB و یکپارچگی با RCSB.
خروجی چندقالبی
دانلود داده و ساختار پپتیدها در قالب JSON، CSV، FASTA یا PDB.
ورود گروهی FASTA
ورود گروهی پپتیدها از فایلهای FASTA توسط مدیر.
دادهٔ مرجع گزینششده
پپتیدهای مرجع سیبزمینی (Snakin-1/2، دفنسینها، مهارکنندههای Kunitz) آمادهٔ کاوش.
دسترسی آزاد
پایگاه دادهٔ کاملاً عمومی — بدون هزینه و بدون نیاز به ورود برای کاوش یا تحلیل.
گالری تصاویر
رابط محصول به زبان انگلیسی است.
مزیتهای کلیدی
تمرکز تخصصی و باارزش
بهطور ویژه برای پژوهش AMP سیبزمینی ساخته شده، نه یک جستجوگر عمومی پروتئین.
تحلیل یکپارچه
ماشینحساب، BLAST و نمایشگر سهبعدی در یکجا — بدون نیاز به ابزار خارجی.
تجربهٔ کاربری پژوهشمحور
رابط مدرن و واکنشگرا با مصورسازی زنده برای پژوهشگران آزمایشگاهی.
مبتنی بر علم
بهسرپرستی پژوهشگران بیوتکنولوژی گیاهی؛ با معیارها و الگوریتمهای استاندارد بیوانفورماتیک.
مقایسه با رقبا
| قابلیت | PotatoPepDB | APD3 | UniProt | NCBI BLAST |
|---|---|---|---|---|
| تمرکز AMP ویژهٔ سیبزمینی | ✓ | ✗ | ✗ | ✗ |
| ماشینحساب فیزیکوشیمیایی | ✓ | ✓ | ~ | ✗ |
| همترازی توالی | ✓ | ✗ | ~ | ✓ |
| نمایشگر ساختار سهبعدی | ✓ | ✗ | ✓ | ✗ |
| داشبورد آماری تعاملی | ✓ | ~ | ✗ | ✗ |
| دسترسی آزاد بدون ورود | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ |
APD3، UniProt و NCBI BLAST منابع عمومی عالیای هستند؛ پوتیتوپپدیبی با مجموعهدادهٔ متمرکز AMP سیبزمینی و جعبهابزار تحلیل یکپارچه مکمل آنهاست.
قیمتگذاری
روی سرور ما مشترک شوید، یا لایسنس نصب روی سرور خودتان را بگیرید.
قیمتها شامل مالیات بر ارزش افزوده است.
آزمایشگاه
قابل لغو در هر زمان
- ✓مجموعه دادهٔ کامل پپتیدها
- ✓BLAST و جستجوی پیشرفته
- ✓تا ۵ پژوهشگر
پژوهشکده
قابل لغو در هر زمان
- ✓همهٔ امکانات آزمایشگاه
- ✓مجموعه دادهٔ خصوصی
- ✓دسترسی API
پرداخت یکباره برای نصب روی زیرساخت خودتان.
نصب اختصاصی
۱۰۶٬۴۰۰٬۰۰۰ تومان پیشپرداخت، سپس ۶ قسط ماهانهٔ ۲۶٬۶۰۰٬۰۰۰ تومان
بدون افزایش قیمت · شامل یک سال بهروزرسانی و پشتیبانی؛ تمدید ۲۰٪ مبلغ لایسنس در سال
- ✓نصب روی سرورهای خودتان
- ✓داده هرگز از شبکهٔ شما خارج نمیشود
- ✓کاربر نامحدود، بدون هزینهٔ بهازای کاربر
لایسنس سازمانی
- ✓استقرار چندسایتی و محیط تست
- ✓SLA، آموزش حضوری و تحویل
- ✓توسعهٔ سفارشی و یکپارچهسازی
پشتهٔ فناوری
PotatoPepDB را امروز امتحان کنید
فرم را پر کنید تا یک دموی اختصاصی و قیمت متناسب با کسبوکارتان دریافت کنید.