PotatoPepDB
پایگاه داده و سکوی تحلیل پپتیدهای ضدمیکروبی استخراجشده از سیبزمینی (Solanum tuberosum).
پوتیتوپپدیبی یک سکوی بیوانفورماتیک برای کشف، مدلسازی و تحلیل پپتیدهای ضدمیکروبی (AMP) استخراجشده از سیبزمینی است. این پلتفرم یک مخزن قابلجستجوی پپتید را با ابزارهای تحلیل فیزیکوشیمیایی، موتور همترازی شبیه BLAST و مصورسازی تعاملی داده ترکیب میکند.
ساختهشده برای پژوهشگران بیوتکنولوژی گیاهی در حوزهٔ آفتکشهای زیستی و محصولات مقاوم به بیماری — کاوش مولکولهای دفاعی طبیعی گیاه را آسان میکند، بدون نیاز به ورود.
ویژگیها
جستجوی ساده و پیشرفته
جستجو بر اساس نام، توالی، شناسه، بافت، فعالیت یا خواص مولکولی با فیلترهای منطقی.
ماشینحساب فیزیکوشیمیایی
محاسبهٔ بلادرنگ MW، pI، بار خالص، GRAVY، شاخص Boman، نسبت آبگریزی و شاخص ناپایداری.
همترازی بهسبک BLAST
همترازی محلی Smith-Waterman در برابر پایگاه داده با مقدار E و امتیاز شباهت.
داشبورد آماری
نمودارهای تعاملی دایرهای، میلهای و پراکندگی برای تحلیل بافت، فعالیت و بار-آبگریزی.
نمایشگر ساختار سهبعدی
مصورسازی مولکولی با NGL.js بههمراه ساختارهای PDB و یکپارچگی با RCSB.
خروجی چندقالبی
دانلود داده و ساختار پپتیدها در قالب JSON، CSV، FASTA یا PDB.
ورود گروهی FASTA
ورود گروهی پپتیدها از فایلهای FASTA توسط مدیر.
دادهٔ مرجع گزینششده
پپتیدهای مرجع سیبزمینی (Snakin-1/2، دفنسینها، مهارکنندههای Kunitz) آمادهٔ کاوش.
دسترسی آزاد
پایگاه دادهٔ کاملاً عمومی — بدون هزینه و بدون نیاز به ورود برای کاوش یا تحلیل.
گالری تصاویر
رابط محصول به زبان انگلیسی است.
مزیتهای کلیدی
تمرکز تخصصی و باارزش
بهطور ویژه برای پژوهش AMP سیبزمینی ساخته شده، نه یک جستجوگر عمومی پروتئین.
تحلیل یکپارچه
ماشینحساب، BLAST و نمایشگر سهبعدی در یکجا — بدون نیاز به ابزار خارجی.
تجربهٔ کاربری پژوهشمحور
رابط مدرن و واکنشگرا با مصورسازی زنده برای پژوهشگران آزمایشگاهی.
مبتنی بر علم
بهسرپرستی پژوهشگران بیوتکنولوژی گیاهی؛ با معیارها و الگوریتمهای استاندارد بیوانفورماتیک.
مقایسه با رقبا
| قابلیت | PotatoPepDB | APD3 | UniProt | NCBI BLAST |
|---|---|---|---|---|
| تمرکز AMP ویژهٔ سیبزمینی | ✓ | ✗ | ✗ | ✗ |
| ماشینحساب فیزیکوشیمیایی | ✓ | ✓ | ~ | ✗ |
| همترازی توالی | ✓ | ✗ | ~ | ✓ |
| نمایشگر ساختار سهبعدی | ✓ | ✗ | ✓ | ✗ |
| داشبورد آماری تعاملی | ✓ | ~ | ✗ | ✗ |
| دسترسی آزاد بدون ورود | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ |
APD3، UniProt و NCBI BLAST منابع عمومی عالیای هستند؛ پوتیتوپپدیبی با مجموعهدادهٔ متمرکز AMP سیبزمینی و جعبهابزار تحلیل یکپارچه مکمل آنهاست.
قیمتگذاری
قیمتگذاری متناسب با نیاز و ابعاد کسبوکار شما.
برای دریافت قیمت و یک دموی اختصاصی تماس بگیرید.
پشتهٔ فناوری
PotatoPepDB را امروز امتحان کنید
فرم را پر کنید تا یک دموی اختصاصی و قیمت متناسب با کسبوکارتان دریافت کنید.