قاعدة بيانات معلوماتية حيوية

PotatoPepDB

قاعدة بيانات ومنصة تحليل منسّقة للببتيدات المضادة للميكروبات من نبات البطاطس.

يبدأ من $25 /شهر جميع الباقات والتثبيت الذاتي

Search interface with field-level filters

بوتيتو‌بيب‌دي‌بي منصة معلوماتية حيوية لاكتشاف ونمذجة وتحليل الببتيدات المضادة للميكروبات (AMPs) المستخلصة من البطاطس. تجمع بين مستودع ببتيدات قابل للبحث وأدوات تحليل فيزيائي‌كيميائي، ومحرك محاذاة على طراز BLAST، وتصور بيانات تفاعلي.

مصممة لباحثي التقنية الحيوية النباتية العاملين على المبيدات الحيوية والمحاصيل المقاومة للأمراض، تجعل جزيئات الدفاع النباتي الطبيعية سهلة الاستكشاف — دون الحاجة لتسجيل الدخول.

الميزات

Simple & Advanced Search

Search by name, sequence, accession, tissue, activity, or molecular properties with logical filters.

Physicochemical Calculator

Real-time MW, pI, net charge, GRAVY, Boman index, hydrophobic ratio, and instability index.

BLAST-Style Alignment

Smith-Waterman local alignment against the database with E-value and identity scores.

Statistics Dashboard

Interactive pie, bar, and scatter charts for tissue, activity, and charge-hydrophobicity analysis.

3D Structure Viewer

NGL.js molecular visualization with PDB structures and RCSB integration.

Multi-Format Export

Download peptide data and structures as JSON, CSV, FASTA, or PDB.

FASTA Bulk Import

Admin batch import of peptides from FASTA files.

Curated Reference Data

Reference potato peptides (Snakin-1/2, defensins, Kunitz inhibitors) ready to explore.

Open Access

Fully public database — no paywall, no login for browsing or analysis.

لقطات الشاشة

واجهة المنتج معروضة بالفارسية.

Search results with sequence and property previews

Peptide detail: physicochemical profile and 3D structure

Statistics dashboard with interactive charts

المزايا الرئيسية

Niche, high-value focus

Purpose-built for potato AMP research, not a generic protein lookup.

Analysis built-in

Calculator, BLAST, and 3D viewer in one place — no external tools needed.

Researcher-friendly UX

Modern, responsive interface with live visualizations for bench scientists.

Scientifically grounded

Led by plant-biotech researchers; standard bioinformatics metrics and algorithms.

مقارنة مع المنافسين

الإمكانية	PotatoPepDB	APD3	UniProt	NCBI BLAST
Potato-specific AMP focus	✓	✗	✗	✗
Physicochemical calculator	✓	✓	~	✗
Sequence alignment	✓	✗	~	✓
3D structure viewer	✓	✗	✓	✗
Interactive stats dashboard	✓	~	✗	✗
Open access, no login	✓	✓	✓	✓

APD3, UniProt, and NCBI BLAST are excellent general resources; PotatoPepDB complements them with a focused potato-AMP dataset and an integrated analysis toolkit.

الأسعار

اشترك على خوادمنا، أو احصل على ترخيص للتثبيت على خوادمك الخاصة.

الأسعار بالدولار الأمريكي، تُدفع بالعملة المشفرة.

Lab

$25 /شهر

يمكن الإلغاء في أي وقت

✓Full peptide dataset
✓BLAST and advanced search
✓Up to 5 researchers

الشراء والدفع طلب فاتورة أولية (للمؤسسات)

Institute

$69 /شهر